1、在拿了凤凰蛋壳和麒麟角后回到圣姑家，圣姑要李逍遥上试练洞找那个傀儡虫，从他婆婆家出去后，碰到有蝎子的小妖，就和他打，打了后会得到一只他要的傀儡虫，然后存盘，再取档，再打、再存、取、打、存、取、打、存、取、打、就行了，到三十六只就OK了！我无意中发现的，呵呵
2、无限取得八仙石和试炼果
八仙石：镇妖塔里面有一种龙，可以偷得八仙石和土遁符
无限取得方法：找***(地图上看起来像蝙蝠的)，打掉以后s***e,quit,load，出来以后可以继续大，这样就可以无限的偷得八仙石，顺便还可以练练级。
试炼果：在镇妖塔剑柱那里会碰见一种红发青蛙(地图上看起来是鬼火),可以偷得试炼果，这青蛙还会召唤术，只要青蛙不满三只，过两个回合他就会召唤一只青蛙出来，身上也有试炼果。
3、在遇到水中合体兽时，用巫后的雷系法术可将它轻易打败。
4、在大里城的居民家中有许多东西可拿[在柜子里]，药店也有。
5、在战斗中输入“cheat”然后：（1）.再输入“v”直接取胜（2）.输入“y”敌人不攻击
6、到大理城时有一店铺，可买金蚕王将李逍遥的体力和真气补到极限999/999。酒神威力达到8000，好爽！
7、很多人到了云姨那里都会去拿三次钱，其实拿一次就会让钱箱爆满！你拿了一次钱就去买剑把钱用到只剩一千多，然后去道士那里，先不要上楼，去掌柜那里买酒，多买几次你就会发现钱用不完了。
8、在水月宫里，在观音像右边可看到一宝箱，调查可得一物品，继续按几下空格可得一把苗刀，在与苗人头领的战斗中丢出去，扣五百多滴血，嘿嘿！
9、在战斗中按——XJPXZ123“shift”攻击力增加1000％。
10、在苗疆的婆婆家,在屋子的右方有两棵树,左方的树中藏有试炼果,而在右方的树下则可***到无限的鼠儿果,所以可以不停的***集鼠儿果,以无***供应的鼠儿果拿去商店变卖,只要有耐心,要发财绝对不是难事!!!
11、在试炼炉的底层,可以发现女娲的陵墓,在其东南角可以发一处秘道,通过秘道后向北走,左上方又有一道***墙,穿过***墙后可拾得芦苇飘,再至下方以芦苇飘过河,便可习得风、火、山、雷、雪五神的召唤术,且可获得玄冥宝刀、无尘剑、金钢珠等至宝。
12、大理城内有一***村庄,武器店柜台后方墙中有一密道,可在黑暗中毫无阻碍的前往村庄内任一民宅中,当黑苗族入侵大理城时,便可利用此密道,避免许多不必要的战斗!
13、不断使用乾坤一掷(钱必须多于五千文)用到财产低于五千文,钱会暴增到上限如此一来就有用不完的钱了
14、在遇见阿奴的师傅的地方调查屋外右边第二棵树可得「鼠儿果」若一直按空白键可一直得到(最多99)
15、巨树林中一桃林终年盖云当拿到风铃珠时用来驱散云雾往里面走可找到桃源村村后会遇到木道人打死他可获赠"寿桃核"每回合可补血、真气二十点
16、当李逍遥与巫后逃命时水魔兽会一直追你但用飞龙探云手可偷到很多毒龙胆这样就不怕七大毒虫了
17、在尚书府时，为了请来道士，云姨会给你三万元，则你可以去买东西（例如武器）把钱用完或低于一万五千元再去找云姨，她会再给你三万元但最多只能拿三次，共九万元。
18、在救灵儿时,于锁妖塔中,下面数来第二层有一种会不停呼唤同伴的河童(长像啦)对它偷东西,可以偷到"试炼果"偷到就将它砍死,只留一只一直给它呼唤,您可以不停的偷，然后偷99个,留给阿奴用试炼果可以加强法力天剑可以强到杀伤700~800点血喔最好让灵儿加入后再用连灵儿法力都999,威力超强!!!
19、当李逍遥等级到达99级时，用5~10只金蚕王，经验点又跑出来了，而且升级所需经验会变回初期5~10级内的经验值，然后去打敌人或佣金蚕王升级，可以学到灵儿的法术（从五气朝元开始）；升到199级后再用5~10只金蚕王，经验点再跑出来,所需升级经验也是很低，可以学到月如的法术（从一阳指开始）；到299级后再用10~30只金蚕王，经验点出来后继续升级，可学到阿奴的法术（从万蚁蚀相开始），等级应该可达999。如果钱不够买金蚕王,那可以到桃源村打狐妖女，一次赚4000多,因为练到一定程度时经验需要很多才能升级。
20、在苏州城买糖葫芦，20元一个；但到当铺当掉的价钱是37元一个。如此反复便有无限金钱。
21、当你到“试炼洞”时***集到蛊卵，再到大理城当铺变卖若干个，然后再次进入物品栏你会发现蛊卵数目还是和原来一样（这样就可以无限变卖了）。
22、在购买东西时同时按住“空格”和方向键右，可以不花一分钱使物品变为99个
游戏秘技
无限提升“灵力”“经验”秘籍
在锁妖塔中、猡刹洞中（二次）可遇见一个或两个的“绿色”会跳的妖怪，在它身上有“试炼果”（灵力+3），千万记住要留一个，好等它再变（无限“偷”“打”“留一个”）。
物品暴增法
我在玩仙剑时发现，买东西时同时按住“空格”和“->”，可以不花一分钱使物品变为99个
金蚕王合成***
在鬼阴坛的右边得到炼虫皿之后，在其中加入“天仙玉露”和“天香续命露”将二者合成，可以得到梦寐以求的“金蚕王”。
疯狂升级法
就是当李逍遥升级到99级的时候，再次给李逍遥使用“金蚕王”，就会发现李逍遥的等级能够继续提升。什么？有什么用？这样不光能使李的各项属性继续提高（现在我的李逍遥的武术已经一千七百多了），而且在100到199级这个阶段，李逍遥会像往常升级学会武功一样学会“赵灵儿”的绝招，在200到299级这个阶段将学会“林月如”的武功，怎么样？至少在打拜月教主的时候，就能有两个人会使起死回生和全体恢复体力的绝招了。
早期升级法
这是我的一点儿小发现，不知是否算早的，希望这点东西能歌其他人带来方便或者是乐趣！
我在玩的时候发现刚进黑水镇时在右方会有一鬼火，碰到后出现扫把妖怪，当你打死其中一只，它会召唤多一只！我试过打完后拿了550以上的经验值！这对初期练功很有帮助！
当你存档再读档时，会发现原先杀了的妖怪又重新出现！哈哈！不用跑来跑去练功了！
无限赚钱法
1/ 当你到"试炼洞"时***集99个蛊卵,再到当铺变卖98个,然后再次进入物品栏你会发现仍是99个蛊卵.(无限卖)
2/ 在苏州城买糖葫芦，20元一个；但到当铺当掉的价钱是37元一个。如此反复便有无限金钱
一些技巧（作者：gumdan）
1、无限金钱的又一方法。
用李逍遥的飞龙探云手偷取一些小角色的物品。等偷到了后马上逃走。这样物品可以拿到，同时小角色没有死去。反复如此，很快就把物品偷到99了。然后把物品卖掉！^_^
2、防卫力到达999
在蜀山的锁妖塔中有一种龙带有一种叫“八仙石”的物品，同样用李哥哥的飞龙探云手去抢，抢到后马上逃，这样很易把它偷到。然后使用“八仙石”这样就可以+2防卫力了。反复如此快快就到999了。
3、金蚕王如何取得
能够使使用者升一级的金蚕王有几种方法取得：
A取宝箱
B**最终几只BOSS也以取到
C物品合成。
D在苗疆一个隐藏地方。（有个地方可以上楼的。在楼内进入一另间房里。就可以看到）
仙剑奇侠传98柔情版功略
一开始被婶婶敲起来后找找房间有东西可拿，先不要用密道，
出房门后可遇到三个苗族的人，到楼下门口又遇到一个醉汉要酒喝，先不要管他，
到厨房去把酒菜拿改楼上有两个人的房间里，客人嫌酒太难喝了(没拿尿给他喝不错了)，所以把酒收起来，拿
的房间......决定上仙灵岛找仙女求药，出门时在门口遇到苗人首领(游戏写苗人头领...我想应该打错了)
会给破天 破解仙灵岛的阵法，再到菜市场旁的港口找张四去仙灵岛，到了仙灵岛后张四在外面等你，所以
就孤身闯进去啦...进去后找到 6 座男的石像，分别用破天 击破(慢慢找吧)，有个宝箱有五张灵符的最好拿一下
，石像都打破后回到起点踩在发亮的地板上会出现通路，进入仙灵洞天，跟著石板路走，到了门口有力场挡住去路
，到下方的湖附近可以找到一堆衣服，原来仙女在洗澡 (这故事『好像』听说过...) ，主角很老实答应不看...(要是我一定会看)，
走左上方走到尽头再转头走回去，人已经不见了，突然打雷...(太老实的结果)...[发生***] 跟著灵儿走入房子后到处搜宝箱，
再到左边房间拿药!
出门遇见姥姥 [发生***] 被强破娶妻...然后计画逃走...逃回家后把紫金丹拿给婶婶吃，
[发生***] 逍遥丧失记忆...夜晚利用密道出门，在门口遇见苗人首领，说了一堆话后出门，到秀兰
家得知秀兰父亲气喘病发作。。至隔壁洪大夫家敲门请他治病，解决后从西北边出去到山神庙学习剑法...
看了一段精彩的动画后回家...房间被强租了无法进入，从下方柴房密道爬绳子上去，调查床旁边的布袋发现灵儿 [发生***] ，
与苗人战斗 (以灵儿为主合攻应可轻易取胜) ，再找张四去仙灵岛救姥姥，到了仙灵岛发现一片惨状...[发生***] 将姥姥埋葬后返回客栈，
先和躲在门口旁的小虎谈话，小虎告知苗人寻仇，进门与苗人博斗，
[发生***] 婶婶被挟持...但被婶婶的穿云手...(之前的生病好像生***的...) [发生***] 婶婶决定让
灵儿与逍遥结伴
寻母，晚上灵儿要求一起睡...(好啊...... 但是主角说不...大宇烂...喔喔，我太冲动了，生气容易长皱纹的)。
临走前婶婶交给逍遥一布包，里面有一本书、绣花鞋、玉镯，使用书后可学到两个新法术，其中探云手满实用的，出门
到港口找张老板搭船去
苏洲，一上岸看到两个人被一个女的鞭打... (这可不是疯狂***面) 打败林月如后把他吊在树上进城去，在
城门口听见求救声... 返回
才知道是***的...再进城，又听到求救声 (知道放羊的孩子吧...所以这次一定是真的) 返回后看到两个人正准备...(开玩笑...我都还没咧
那轮得到你们) 打败两人后月如留下一把剑，捡起来，进城后得之比武招亲的事，在当铺有个人要借钱 (不借免得损钱) 然后进客栈的
中看到一个人被打，打拜三个人解救书生(多利用探云手)，出客栈时遇到一个***仙给他***...然后去看比武招亲，会遇到书生(刘晋元)， [发
生***] 上台比武打败月如(先用探云手分别可得 500+250+125+62 元) [发生***] 之后便在东厢房，出房门在庭
院中与月如谈话，再到西厢房和灵儿谈话，再到前厅会有***仙来合八字，突然西厢房发现妖怪，赶至西
厢房，[发生***] 追到蛇妖洞(洞很大，慢慢逛吧) 到门口先打败蛇妖，进去后发现里面全是女人，但是看到人就跑，先
把宝箱搜乾净后再到最里面打败蛇妖女 (要小心她的催眠术) 解救了人质以后从锁著的那道门出去(嘿，怎麽出去自己想一下.......)
出来后可以见到一村庄，到北边找到韩医生 (也找到灵儿)，把医生给你的药方拿给门口的煎药童子，
他会告诉你需要 人参、雪莲子、何首乌、银杏子、鹿茸、鲤鱼 这些药材，其中你只要找 鲤鱼、鹿茸、银杏子 就可以了，其
它的月如会帮你找，
先到下方渔夫家中借钓具再到湖旁边使用钓具就会得到鲤鱼，然后从下方出村庄，
村门口有人告诉你路上放了捕兽夹，走一段路后看到补兽夹，把它拿起来，放到鹿常跑的路上，然后把鹿『赶』到捕兽夹
，调查鹿就可以得到鹿茸，然后回村装韩大夫家，在韩大夫家后面有一颗杏树，调查可得到银杏子，把药材集全后拿给煎药童子，
把煎好的药拿给灵儿喝，灵儿复原后加入，大伙决定去抓鬼，所以从西边的桥出村装，先往玉佛寺，进去后 [发生***] 打败三和尚，
再打败一***可得玉佛珠，装备在灵儿身上可使灵儿能力大增，
然后再转往北方乱葬岗找到一发光的入口，进去尽你的能力找到一里面躺著将军的棺材 (迷宫很大) 打败他后掉入水
池，再走到
一有漩涡的地方打败赤鬼王，可得到土灵珠。
回村庄向韩大夫辞行，突然大夫的女儿梦慈被抓走，再度前
往鬼阴山，找到鬼阴坛 (又是迷宫) 找到梦慈后 [发生***] 战斗后(一定失败) 被关起来，灵儿被绑走了，从另一侧的门追去，
追到扬州城，进客栈说要住，走到房间内，到了晚上被惊醒，原来遭小偷了，从左侧房间追出，走屋顶直到遇到女飞贼头目，
打败女飞贼头目后把遗留下的布交还给隔壁间的古董商，没想到反被诬赖，
外出往北边过桥右边与三姑六婆交谈得知寡妇家有密门，进去与寡妇谈话，月如吃醋跑走了，从客栈的房间上屋顶追回月如
[发生***] ，再返回进入井中，找到金葫芦 [发生***] 被官差抓走，被毒打一顿 (一定要招，免得被打***的) 县令答应让主角去
找证据，出衙门到姬三娘家，
走到神桌前踩机关会出现密门，进入追到姬三娘后打败她 [发生***] 主角的冤枉得以洗清，出扬州城往北走，路上遇到秀才，
他想雇你当保镳，答应他可得到 1000 元，在凉亭外遇到剑圣警告有血
光之灾，还是继续走，但是秀才离开了，走到半山腰发现中剧毒死亡的古董商，调查可得一布包，走到最上面遇到一 Cool Girl
，跟著她进山洞，没想到被轰出来，走出来后不甘心，又进去，那 Cool Gril 变成鬼母，又带了一只蛤蟆精，打败他们后调查
蛤蟆精可得五毒珠，进
后面的山洞(右边都是宝箱，左边可出山洞) 出来后看到一间客栈，进去休息一下 [发生***] ，出门外救醒盖罗骄后前往京城，
(需
先与船家谈话，遇到月如的伯母) 至尚书府中得知晋元身染重病，至后花园晋元房中找晋元，再出尚书府，
把古董商的布包交还给尚书府对面的那一户人家，对方将以紫金葫芦做为谢礼，并可得到灵葫咒，
在怡红院右方有一乞丐可探听到两个消息 (不过要钱) 回尚书府月如的父亲林天南追来，并要求跟他过招，
只要能挡住他的七诀剑气就可以了，不必做攻击，事情解决后到晋元房间叫醒晋元，出来后往大厅走，
半路上遇到刘夫人，再谈一次话可得 30000 元要逍遥去请道士 (不论多少钱是她说的)
出门后别急著请道士 (奸诈的各位请先用这些钱去买武器防具，不够再回刘夫人那拿，多拿几次，
但钱要低於 15000...等买够了再去请道士) 客栈一楼有个***的，
把以前欠他的钱还他，再交谈一次他会给你箴言，到二楼请道士除妖 。
[发生***] 道士被吓跑了，出晋元的房间发现所有人都睡著了
，至夫人房间发现晋元不见了(请顺便把宝箱拿一拿，后面会用到) 调查夫人两次后离开，出尚书府，在尚书
府旁的水里发现一具『尸体』，把『尸体』捞起来，赫然发现是酒剑仙 [发生***] 酒剑仙需要蜡烛、符纸、檀香(以上在尚书府都有)
、酒 (在客栈买得到) 把这些东西交给酒剑仙， [发生***] 酒剑仙做法睡著了，月如自己跑去找妖怪，去
追月如，往晋元房间方向走，半路
上遇上妖怪，打两下子妖怪就跑了，追到最北方森林内，尽可能找到黑蛛打败它， [发生***] 跟随酒剑仙到蜀山剑派，跟酒剑仙、剑圣谈话
过后到左上方房间桌上拿玉佛珠，再和剑圣谈话 [发生***] 决定进锁妖塔中救灵儿，塔中有一个被锁在壶中的
妖怪，救他出来他会帮助你 (一
开始想吃你，神灯巨人......) 再到北方铜门前他就会帮你把门打开...再上一层有个人会在传送点前问一个问题 -> 先跨左
脚或是右脚...到左上方的
地上找到一本书，里面有书中仙，把他带去解决这个问题... 到了塔顶后找到灵儿 [发生***] 打败镇狱明王，决定破
坏塔逃出去，但是需潜入
化血池中，走到右下方有个漩涡的地方跳下去，依序打败每个守护龙 (按法术的相克原理可以很轻易的打败) 把
守护龙全解决后 [发生***]
获救后月如死亡，灵儿垂危，需要凤凰蛋、麒麟角医治，捞叨一阵子后出门，在门右边有香焦树，调查可得两串香焦，
先到森林去找凤凰蛋，只要有小猴子挡道就给它香焦，尽量找到凤凰鸟后打败它，但是凤凰蛋被偷了 [发生***] 跟阿奴交换条件
，答应她帮她找水灵珠，进洞窟后发现没啥东西...宝箱搜括完毕后由另一侧踩机关开门出来，回白苗族部落，到左上发找到开会的族长
，再到右边骗开守卫进火麟洞...尽量找到火麒麟将它打败 [发生***] 可得火神珠和麒麟角，
再到右方神殿去，祈导后会回到十年前... 一开始遇到一个人带著一小孩，打败二名士兵解救他们，再打败拥来的三名士兵
[发生***] 到王宫***，原来发生了***，到王宫右方的牢房与娘娘谈话，她需要天蛇仗，进大殿中间的门可通往地下室
，进去后找到一个人说完口令后可通过，进去找到天蛇仗，回去拿给娘娘
[发生***] 被娘娘拖著水遁.......[发生***] 水中遇到合体兽，用雷系法术可以轻易打败它，但要逃快一点，不然再遇上还要再打一次!!
找到出口后 [发生***] 醒来时在岸上，到山神庙去，找到刚被逍遥救的两个人，他会要你拿手绢到港口给一个人，
拿到港口去给一位商人(灵月宫主) ***解决后逍遥的婶婶出来找小时候的逍遥，到港口武器店买一把木剑，待会会用到。
再走回山神庙，到左上方发现有一条小路，走到一树下发现有
宝箱，调查宝箱 [发生***] 小时候的自己出现，并要求以一把木剑交换，将
木剑交给他就可得到水灵珠并回到现实 [发生***] ，已经过了一个月了，阿奴会把蛋壳
交给你，回灵儿那(还没死啊...) 把两种药材交给婆婆 [发生***] 数月后灵儿生产，但婆婆要
逍遥去试炼窟找 36 个傀儡虫，如果以前宝箱有找得仔细的话，这时应至少有 1X 个傀儡虫了，在往部落
右方试炼窟途中遇到盖罗娇，打败她后阿奴加入... 入洞窟打妖怪可得到傀儡虫，(集满 36 只送 3DO 喔
...) 集满后用土灵珠脱离洞窟回婆婆那把傀儡虫交给她，灵儿痊育后加入，回部落时发现黑、白苗族正在打仗，至神殿
祈导后可得圣灵珠，再到神殿右边的祭坛，在碑文前使用圣灵珠就会出现放灵珠的台子，把各以前得到的灵珠照如此方位放置:
火 雷
水
风 土
全放对后 [发生***] 把怪兽打败后从地洞跳下.......走了很长一段迷宫 (在此尽
量练等级) 走出来后是黑苗族的王宫，到大殿去遇到灵儿的父亲(***的) [发生***] 打败两名士
兵后再打败***的国王......解决后请把自己的体力、真气全补满，最好记录...... 走出后到中间水池中与法
师战斗 (钱都用乾坤一掷丢了...) 把那家伙干掉后就可以欣赏『悲惨』的结局了......
您好~~
余杭县有个小渔村有个孤儿李逍遥，父母是号称武林中的神仙侠侣，但从李逍遥小时就音讯全无。他由婶婶带大，在自家开的客栈中当个店小二。
小镇·客栈
李逍遥正做斩妖除魔的美梦时，被婶母李大婶用铲子打醒，有客人上门还不起来帮忙。出房门招待3位苗装客人，得到500文赏钱。李逍遥下楼后，李大婶要他将门口要酒喝的道士赶走，但道士却是没酒喝就不走，正相持不下，李大婶又让李逍遥到厨房端酒菜到楼上给苗人首领，结果苗人首领不喝，两个喽罗又嫌酒淡，于是李逍遥就把桂花酒给了门口的道士。道士为了谢他赠酒之情，约他明天晚上三更到十里坡的山神庙见面。稍后，李大婶叫李逍遥到菜市场买新鲜的虾。
小镇·港口
从东南的出口走到小镇的港口，这里也有小镇的菜市场、铁匠铺和木匠铺。菜市场的鱼贩和渔夫都说这几天风浪太大，捕不到虾，李逍遥只好空手而回。在村口见到香兰报知李大婶病倒，急急忙忙地赶回客栈。
小镇·客栈
在客栈中洪大夫说李大婶久病不医且疲劳过度，他也没有医好的把握。洪大夫走后，李逍遥在客栈门口见到苗人首领，他告诉李逍遥仙灵岛水月宫可以得到治百病的仙丹，但是宫外有一座用仙法设下的迷阵，不破去阵眼就无法进去。随后给了李逍遥一把破天锤，在敲破阵中的6具阿修罗神像后，自会出现一块发亮的石板，踩上去就会出现入宫的通道。并以防瘴气为名，让李逍遥吞下忘忧散。
小镇·港口
渔夫张三为李逍遥孝心所感动，答应载他到仙灵岛取仙药。
仙灵岛·迷阵
李逍遥在仙灵岛的迷宫中找到6座阿修罗像，逐一用破天锤打破后，果然出现一块发亮的石板，踏上去后果真出现一条通往水月宫的通道。
仙灵岛·树林
李逍遥沿着两旁种满绿树的通道进入水月宫，在西南方湖边的大石上看到一套女子衣衫，他好奇地驱前观看，果有一少女正沐浴。待少女上岸穿衣，李逍遥要她带他进水月宫取药，以换回衣服，少女被迫答应，但要他放下衣服向后走出十丈开外，且不许向湖边回头。李逍遥照此做后，却不见少女踪影。此时天上打雷，李逍遥以为触犯神灵，吓得跪地求饶，说出为婶母求药的经过。听到他对神灵的祈祷，少女赵灵儿同情他的孝心，于是带他进了水月宫。
仙灵岛·水月宫
在水月宫丹房，赵灵儿给了李逍遥一粒紫金丹。他拿了药正要离开，在门口遇到一老妪，化身为蛇尾人身怪物，将李逍遥吓晕在地，幸赵灵儿赶到，告诉姥姥事情的经过。姥姥虽不杀李逍遥，但要李逍遥选择是娶赵灵儿为妻且永不离开仙灵岛，或是留下双手和舌头回家。李逍遥不得已只好答应娶赵灵儿为妻。当晚在洞房，李逍遥告诉赵灵儿他必须送药回家。赵灵儿说他可趁姥姥早上到他师父灵前上香的机会离开仙灵岛。第二天分手时两情依依，李逍遥告诉赵灵儿永不相弃，然后到海边搭船回了小镇。
小镇·客栈
李逍遥将紫金丹给李大婶服下后，忘忧散的效力正好发作，醒后将仙灵岛之事忘得干干净净。晚上，他想起和道士在山神庙的约定，从床右边的密道离开客栈，从小镇的西南方出口，向西北行至山神庙。
山神庙
在山神庙中遇道士，他说平生不愿欠人情，因此教李逍遥一式御剑法。李逍遥欲拜他为师，他却乘风而去。眼见天亮，李逍遥赶回客栈。
小镇·客栈
回到客栈，见到苗人喽罗背一个***袋进了李逍遥的房间，又不让李逍遥进屋。李逍遥从仓库的密道潜入房间，打开麻袋，见到赵灵儿昏迷在内，救醒赵灵儿后，得知苗人杀上仙灵岛，姥姥受了重伤，她要回去救姥姥。说着说着，惊动了苗人守卫，双方打了起来，苗人不敌逃走。
仙灵岛·水月宫
李逍遥陪赵灵儿回到仙灵岛，只见水月宫尸横遍地，姥姥已剩下最后一口气，她说赵灵儿是苗疆黑苗族巫王之女，母亲巫后十年前因遭人陷害，生死不明，赵灵儿由姥姥带到水月宫躲藏。现在姥姥要李逍遥带赵灵儿回苗疆探查巫后的下落，以尽人子之责。说完姥姥就驾鹤西归了。李逍遥和赵灵儿料理完后事也乘船离开了仙灵岛。
小镇·客栈
苗人首领正在客栈中等他们回去，他们奉巫王之命要带赵灵儿回苗疆。赵灵儿不走，与李逍遥联手与苗人打了起来。此时李大婶从菜市场回来，苗人首领想要挟持李大婶，却不知李大婶也会武功，一掌就将苗人首领打死。
当天晚上，李逍遥听到赵灵儿哭声，过去安慰她，赵灵儿要他留下，而李逍遥因服了忘忧散而忘了和灵儿在仙灵岛相会之事，害怕他人议论，不敢留下。赵灵儿以为李逍遥背恩忘情，哭得更加厉害，惊醒了李大婶，赵灵儿把心事告诉李大婶。
第二天，李大婶交给李逍遥一个包袱，要他陪灵儿回苗疆寻母。李逍遥打开包袱，学会父母留下的武学冰心诀和飞龙探云手。李逍遥和赵灵儿来到港口，搭方老板的船到苏州。
苏州·城外
到了苏州城郊，南武林盟主林天南的独生女林月如正将私奔的长工阿福和丫环银花绑在树上鞭打。李逍遥过去阻止林月如，两句不合就动手较量起来，林月如不敌。李逍遥放了银花和阿福，并把林月如绑在树上让她也尝尝被绑的滋味。走不多远听到林月如的呼救声，转回去打败欲趁机非礼林月如的两个小毛贼，将林月如松绑，却被林月如用剑刺伤。林月如也吓得逃走。为救濒死的李逍遥，赵灵儿使出还魂咒救他一命。
苏州
苏州城中正盛传着南武林盟主林天南要为女儿林月如比武招亲之事。连客栈也被林家包下，只要是参加比武招亲的人皆可免费住店。李逍遥并不参加招亲，就不能住在客栈里。正要离去之际，见到3名大汉欺负文弱书生刘晋元。李逍遥为他解围，刘晋元请二人到他房中，将床让与赵灵儿睡，自己与李逍遥彻夜长谈。
苏州·林家堡
第二天，刘晋元一大早就离开了客栈。李逍遥也和赵灵儿来到林家堡看热闹。擂台上下热闹非凡，虽有不少人上台挑战，但都被林月如轻松打败。林月如又将一人踢下台，正好压在李逍遥身上，这一下林月如看到李逍遥也来了。为了报昨日被绑之仇，林月如出言挑战，李逍遥为化解仇怨，只好上台相斗。不料在打败林月如后，林父出面宣布李逍遥既已获得胜，就是林家未来的女婿，不由分说将李逍遥和赵灵儿请回家中。
林天南见李逍遥会御剑术，误以为他是蜀山仙剑派独孤剑圣的***，虽经李逍遥解释清楚，仍很满意能有这么一位武功高强之人可继承他武林盟主的宝座。李逍遥正要推辞，此时一同入内的刘晋元已情急出声，原来林刘两家为世交，刘晋元自幼喜欢上林月如，但林月如只把刘晋元当兄长看待。此时刘晋元表明心迹，不但遭林月如拒绝，林父也因其不会武功而难以继承家业给予婉拒。刘晋元失望中离去。李逍遥无从分辨，和赵灵儿在林家住下。晚上，赵灵儿身体不适在房内休息。李逍遥在后花园遇到月如，正想和她解释清楚招亲的误会，婢女秋菊说林父要他们到前厅见面。原来要父找来了一位***先生，要给他俩合对八字。此时婢女冬梅来报，灵儿所住的西厢出现怪物，林父要管家林忠召集家人，备齐火把前去抓妖。李逍遥心系赵灵儿安危，独自持剑入内，朦胧中只看到一个蛇尾人身的怪物破墙而去。待月如点灯一看，已不见赵灵儿的踪迹。李逍遥和月如正要尾随追查，却为林父所阻。婢女冬梅见半人半蛇的怪物形似灵儿，林父指其为，要李逍遥与她绝裂，但李逍遥不肯从命，并立刻要从墙上的破洞离开林家去找灵儿。林月如现在已对李逍遥动了真情，不顾父亲的拦阻，亦要陪李逍遥去找灵儿。林月如说，西边有一个隐龙窟，据说有半人地蛇的怪物藏匿其中，四处掳掠年轻女子，灵儿可能就是为该洞蛇妖所掳。
隐龙窟
李逍遥与林月如在隐龙窟的深处见到半人半蛇的男蛇妖，李逍遥令他交出灵儿，并与蛇妖打了起来。杀了蛇妖进入蛇妖洞府，救出许多被掳来当婢女的女子，却不见灵儿的踪影。在一间华丽的石屋里见到了女狐精，李逍遥将她击毙，得到了石钥匙。用石钥匙打开了洞西边的一扇石门，将被掳来的女子送出隐龙窟。
白河村
从隐龙窟向西走，到了白河村。白河村邻近的黑水村已经被僵尸给毁掉了，村民们担心僵尸迟早也会侵入此地。李逍遥和林月如去拜访村长韩神医时，见到昏睡的赵灵儿。韩神医说，灵儿因昏倒在野外而被救起但她现在身体还很虚弱，因此要李逍遥去找一些药材回来。从韩家门外的煎药童子口中得知，目前还缺人参、雪莲子、何首乌、银杏子、鹿茸、活鲤鱼的肝这6味药材。月如回家去取人参、雪莲子、何首乌，李逍遥在韩家屋后的银杏树可以得到杏子，再到村中渔夫家借钓具，到湖边钓得活鲤鱼。出村口见到一名猎人，说已在路上设下捕鹿夹子，将猎人的夹子拿走，设在鹿会经过的地方，就可以抓到鹿，取得鹿茸。回到韩神医家，林月如已经取回另三味药，将6种药材交与煎药童子，煎得六神汤让灵儿服下，赵灵儿果就痊愈。为报答韩神医，李逍遥决定帮白河村民解决僵尸问题。韩神医的女儿韩梦慈提到只有玉佛寺主持智修***可以对抗尸妖，但去求救的人都没有回来，据说都在那里出家了，就连与韩梦慈有婚约的江少云也一去不回，于是3人自告奋勇去一探究竟。
玉佛寺
白河村的守桥壮丁告诉李逍遥3人，过了桥西北方是玉佛寺，东北是黑水镇，西南有座鬼阴山，原有山贼出没，现在被一群苗人所占。到了玉佛寺，见到的僧人都净默不语，只会念阿弥佗佛，其形颇为诡异。李逍遥三人由一名叫智泽的小和尚引见主持智修***，想不到这个老和尚二话不说，就要将李逍遥剃发为僧。李逍遥不同意，智修***以武力相迫，打败这群和尚后，才知道智修和这座庙都是小和尚智泽变出来的。他是达摩法师所持的佛珠经过999年修练所幻化的。由于他看到佛经有云“普渡众生”，“***皆有佛性”，以为逼人为僧即可修成正果。赵灵儿告诉他之所为实在是背道而驰。智泽深受感动，决定帮李逍遥3人消灭尸妖，将功折罪。赵灵儿要他回复原形，取名为小石头。
小石头说，黑水村的尸妖是来自村子北边乱葬岗的隋朝将军墓，其地底血池中藏有一名赤鬼王，他控制僵尸，吸取人血以修练魔功。进入将军墓最深处，打败将军所化的僵尸，3人就会掉入更深处的血池，在这里遇到赤鬼王。杀了赤鬼王后会得到土灵珠。灵儿说自古相传，女娲聚天地之灵气风、雷、水、火、土，炼成五颗灵珠，以镇伏群魔。3人借助土灵珠的力量回到地面。
鬼阴山·鬼阴坛
回到白河村向村民报喜讯，却被告知韩梦慈已被苗人带走，并留言要灵儿单独一人去换她回来。于是立即赶往鬼阴山，在鬼阴山山口有两名苗人守道，只准灵儿一人上山，于是又是一场战斗。3人突破重重关卡，终于在黑苗族设在此地的鬼阴坛中见到了负责接灵儿回苗疆的石长老。石长老说，十年前黑苗族中发生一场剧变，巫后身亡，姥姥偷偷带灵儿离开。而今巫王已时日不多，希望灵儿能够回去见他一面，并继承王业。李逍遥不敢让灵儿回去冒险，因此和石长老发生冲突，结果败在石长老手下。石长老以李逍遥和林月如的生死胁迫赵灵儿随他回苗疆。赵灵儿没有其他选择，只好答应。
扬州
李逍遥与林月如追踪石长老，从鬼阴坛的石门离开，翻过了一座山，来到扬州城外。扬州城此时正闹女飞贼，太守下令百姓行人许入不许出。进入扬州城中，得知现任知府也不是好人，加上城中女飞贼出没，人心惶惶。晚上客栈邻房突然传出抓贼的叫声，月如冲出去，在走廊上拦住一名身穿黑色夜行服的蒙面女子，但李逍遥赶到时已让她逃脱，李逍遥尾随女飞贼从客栈二楼左边的通道出去，沿着城墙，踏着屋顶，紧追不舍，终于拦住女飞贼。女飞贼见敌不过两人，就抛下一个布包，跳入一座宅院的院子里逃走。李逍遥将布包还给邻房遭窃的古董商，想不到布包中少了一个紫金葫芦，反而被古董商怀疑。隔天早上，李逍遥和林月如回到女飞贼失踪的宅院附近查看，从三姑六婆口中得知此屋最近搬来一位有钱的寡妇，颇为可疑。两人前往探访，女主人姬三娘说昨晚没有听到动静，并出言勾引李逍遥，气得月如转身离开。李逍遥好不容易才在西边的城墙上追上负气的月如，见到姬三娘在井边鬼鬼祟祟地走动。于是两人深入井中，在一间藏宝密室中找到了失窃的紫金葫芦。不料官府的衙役接到密报已将井口团团围住，将二人带到公堂审问。太守不分青红皂白就要用刑，林月如报出她是南武林盟主之女，当朝尚书是她的伯父，太守不敢对她用刑，却对出身寒微的李逍遥严刑拷打，李逍遥只好答应太守三天内找出飞贼，以洗刷两人的罪名。月如被扣留在衙门内充当人质，李逍遥一人出外寻找线索。此时井口已被官府封锁，无法进入调查。姬三娘住所已人去楼空，李逍遥在大厅神案前找到一块特别的方砖，踩上去在屏风后就出现一条暗道，暗道通往井下的藏宝室，从藏宝室向井口方向调查，终于在靠近出口处找到姬三娘的藏身之处。制服了姬三娘，将她带到公堂，她也承认了所有的罪名。月如终于重获自由，两人离开扬州北行。
毒蟾洞
从扬州北门走入山区，听到路人谣传山上出现像牛一样大的蛤蟆精。一位秀才见他们身背宝剑，必有武功，愿出2000文钱，请他们护送到京城，并先付一半为定金。行至半路，遇到独孤剑圣御剑飞来，说他夜观星斗，预见今日此地会发生极大的血光之灾，一句话吓跑了秀才，但李逍遥艺高人胆大，还是要赶在日落前下山。在半山上看到那位古董商死在路旁，身边有布包一个，似乎是为毒物所害。再往前行，见到一名女子走入一个山洞，于是入内问路。该女子告诉他们往北的栈道已被她拆了，再过几天还要把往南的山道封起来呢，说完赶他们下山。走出山洞，月如认为她不是好人，两人再度回去探明究竟。原来这女子是鬼母，她见二人发现她的秘密，就和蛤蟆精与二人打了起来。李逍遥打败毒蟾鬼母后，剖开蛤蟆精的肚子，得到能避百毒的五毒珠。
野店
穿过毒蟾洞后，李逍遥二人进入路旁的小饭店，这家店是由一群穿白衣的苗女所开的，从老板娘盖罗娇的口得知她们是为避人而到中原定居的。酒中含有昏睡药，没多久，两人就双双倒下。不久盖罗娇就拦住稍后到达的石长老等人，盖罗娇要石长老交出赵灵儿，石长老不敌，使出玉石俱焚的法术赤血毒焰自爆伤敌。待李逍遥和林月如醒来后，将被震伤的盖罗娇救醒，得知灵儿已被独孤剑圣带走，不知去向。月如说她在京城有个姨妈，许久未见，要李逍遥陪她顺道去看看。
京郊·小镇
李逍遥二人来到京城郊外的小镇上，镇上有位水仙尊王庙，正赶上刘尚书的夫人前来上香，一行兵丁拦住旁人，不得进入，连港边唯一一艘船也被尚书夫人包了下来。正愁不得进京，尚书夫人带着家人来到，原来她就是月如口中的云姨，刘晋元的母亲，因此一同进京。
京城·刘宅
云姨告诉林月如，刘晋元自从苏州回来后就得了一种怪病，群医无策，现在正在后花园的厢房中疗养。月如和李逍遥去探病，正看见刘晋元的病又发作了，疼得大叫。一名彩衣美女闻声而至，服侍他吃药后才安静睡着。这名彩衣女子名为彩依，是刘晋元刚娶的妻子。离开厢房时，婢女来报，夫人请两位用餐。用餐时云姨告诉两人彩依嫁给刘晋元的经过。
京城·大街
饭后，林月如带李逍遥出门逛街。到刘家对门古董商家，将布包交给古董商的妻子，得到回送的紫金葫芦，从葫芦的底部学到灵葫咒。在酒馆中遇到在苏州曾见过的***仙，由于预言很灵验，李逍遥执意赠他500百文礼金。桥头有位乞丐，给他身上一半钱，他会说到他曾在刘家后花园见到彩依变成蝴蝶精的事。再给100文，他会说妓院最近来了一位小莲儿。李逍遥疑心是灵儿，赶去调查，结果不是。回到桥头，见刘府婢女阿萍来报，刘夫人要二人赶紧回去。
京师·刘宅
回到刘宅才知，原来是林月如的父亲来了。他要李逍遥单独和他到后花园谈话，实为要试李逍遥的武功。李逍遥挡下林父的七诀剑气后，林父就离开了。正当李逍遥和林月如在树林前谈话，看到彩依从树林中走出，吓了一跳，因此再到厢房探视刘晋元，偷看到刘晋元怀疑彩依的来历，不肯吃药，将药打翻。彩依不得已将刘晋元迷倒，再度出门去***药。李逍遥将刘晋元救醒，三人出门遇到云姨。云姨要刘晋元暂时到她的房里休息。此时，婢女阿香提到她家乡如有人梦游不醒就会找道士做法，因此云姨给李逍遥3万文，托两人出外找个道士来捉妖。
京师·大街
两人在酒馆中找到一名自称是太乙***门下***的茅山道士，索价15000文。
京师·刘宅
茅山道士看过刘晋元的病后，判断刘晋元所中的毒是盅毒和一种不知明的毒，常人如果中了毒都活不过7天，而刘竟活了一个月，因此甚为奇怪，要到刘晋元房中查看。到了厢房，道士称房中有妖气，要作法驱妖，却屡次失败，吓得逃走。月如和李逍遥一出厢房见有异物飞过，同时飘来令人昏睡的牡丹花香，两人紧闭呼吸，没有昏倒，但刘府其他人等都因此而昏睡了。刘晋元也不见了。府外兵士未得刘尚书的命令也不敢入内。此时，刘府外河里漂来一具尸体，李逍遥将其捞起一看，却是传授他剑术的酒剑仙。酒剑仙打个哈欠醒来，听李逍遥说后要他准备开坛作法的用具蜡烛、符纸、檀香和酒。取得用具后，酒剑仙在刘府后花园施展醉仙封魔***，结果作法没多久就睡着了。月如以为他喝醉了，到后花园见到变回蝴蝶的彩依和昏迷不醒的刘晋元。月如不听彩依的解释，持剑相逼。彩依不得已将刘晋元带到树林里面。
树林
李逍遥和林月如追进树林，见到彩依带着刘晋元飞到一张大蜘蛛网前，听到她与蜘蛛的谈话，才知道事情的真相。原来，一个月前彩依不小心被困在蜘蛛网上，为刘晋元所救，但刘晋元也因此被蜘蛛精黑娘子下了缠魂丝之毒。彩依为了报恩，化身为人嫁给了刘晋元，原想用自制的百花仙酿救治他的病，结果刘晋元怀疑，拒绝用药。如今刘晋元的病情恶化，只好带着刘晋元来见蜘蛛精，愿以己身换取刘晋元的性命。李逍遥一看误会了彩依，挺身与黑蜘蛛相斗，由于黑蜘蛛一死，此毒无人可解。彩依只好将千年道行输送给刘晋元，以换取十年寿命，并要林月如永远不要告诉刘晋元真相，以免他伤心。失去千年道行的彩依失去了变为人形的能力，化为一支蝴蝶翩然而去。稍后刘夫人赶来，带病愈的刘晋元回府。
李逍遥因灵儿之事请酒剑仙带他去蜀山找独孤剑圣，酒剑仙也有心收李逍遥为徒，于是施展飞仙术带李逍遥和林月如回蜀山。
蜀山·仙剑派
到蜀山仙剑派后，酒剑仙带二人见过师兄独孤剑圣。李逍遥向独孤剑圣问及灵儿之事，独孤剑圣一口否认。李逍遥在练丹房见到小石头化成的玉佛珠。小石头说，灵儿已被剑圣关到锁妖塔中。李逍遥持玉佛珠向剑圣质问，剑圣认为灵儿是个，因此关入锁妖塔中。由于仙剑派***皆不得进入锁妖塔，因此李逍遥放弃拜酒剑仙为师的打算，酒剑仙有感于李逍遥的真诚，虽无师徒之名，却再度向李逍遥传授逍遥酒神咒、醉仙望月步，仙风云体术等法术，并赠以雷灵珠，送他们到后山门。
蜀山·锁妖塔
进入锁妖塔，李逍遥和林月如被传送到塔顶，从塔顶往塔底一层一层往下寻找灵儿的下落。两人终于在一层插有巨大剑柱的大厅中找到灵儿。此时李逍遥也记起仙灵岛的事情，他并不介意灵儿的身分，月如也同意与灵儿共侍一夫。这时镇狱明王突然现身阻止，李逍遥一看唯有武力可解决，与月如、灵儿联手打败了镇狱明王。这时在第五层从坛中救出的天鬼皇带领大群妖魔出现，要李逍遥帮忙他们离开锁妖塔，但却没有有人知道离塔的方法，这时在第四层遇到的书中仙说塔底的化妖池中有7根七星蟠龙柱，是支撑锁妖塔的，只要将柱子砍除即可，不过要小心守护柱子的神龙。由于化妖池水会融化妖魔，只有李逍遥三人可下。找得一入水口后，3人即潜进化妖池中，陆续击败7只守护神龙后，将龙柱全部推倒，顿时锁妖塔完全崩毁，而月如为救李逍遥和赵灵儿，不幸被巨石击中。
苗疆·圣姑家
独孤剑圣面冷心热，亦为李逍遥的真情所感动，危急中将3人救出锁妖塔，送到苗族长老圣姑家中治疗。李逍遥只是皮肉伤，灵儿因有孕而动了胎气，唯月如因被巨石直接打倒，已是回天乏术。李逍遥醒了之后，圣姑要他到神木林的金翅凤凰巢中取回凤凰蛋壳，并到大理城的火眼麒麟洞中取得麒麟角合药，给灵儿安胎。
神木林
从圣姑家外的一棵树上拿到多个鼠儿果，在香蕉树上***得香蕉2根。过了一道桥后，来到西南方的神木林。由于凤凰喜欢在高枝上筑巢，李逍遥攀枝越树，途中两次遇到小猴子挡道，均用香蕉打发。最终见到凤凰巢，赶走了护巢的凤凰，正要取蛋，此时有一小苗女出现把蛋抢走，追赶之际，从树上跌下。小苗女将李逍遥救醒，得知小苗女是白苗族长的女儿阿奴。由于圣姑合药只要蛋壳，阿奴答应他小凤凰出生后，就将蛋壳给他，但在此之前，李逍遥需帮她到一处隐密的树洞是偷妖怪的宝物。
树洞
阿奴带着李逍遥来到一个树洞中，趁妖怪首领离开时进入洞中，想不到他们翻遍整个藏宝室也找不到阿奴所要的水灵珠。原来阿奴想要找到水灵珠祈雨，来化解自从巫后之变以来长达10年的旱灾，化解白苗族和黑苗族之间为争夺水源而引起的战争。
大理城
阿奴没找到水灵珠，失望地离开树洞，带李逍遥进入大理城，伺机进入麒麟洞。大理城是白苗族首府，为了抵抗黑苗族的进攻，目前呈现剑拔弩张的警戒状态。火眼麒麟是白苗族的圣兽，未经族长允许，两人当然不得入内。阿奴先去找她母亲白苗族长，族长正在开会商量如何对抗黑苗族，没时间和阿奴长谈。阿奴离开会议厅，正好遇见守卫麒麟洞的士兵正好抓到一位奸细前来报告，因此心生一计，回到麒麟洞前，骗走另一位士兵，和李逍遥进入麒麟洞。
大理城·麒麟洞
李逍遥和阿奴在洞中找到火眼麒麟，阿奴调皮，去揪正在睡觉的火眼麒麟的胡子，醒来的火眼麒麟与李逍遥打了起来。击败的火眼麒麟化成人形，问李逍遥的来意，知道灵儿是女娲后裔，很大方地拔下一支角送给李逍遥，并要李逍遥到大理城中女娲神殿走一趟。
大理城·女娲神殿
女娲神殿是白苗族祭祀女娲女神的地方，殿中蛇尾人身石像据说是十年前大水灾时带来的，因其与女娲神形似，故在神殿里供人祭拜。李逍遥见石像容貌与灵儿极为相似。不由得向前察看，却被传送到一个地方，在此见到灵儿的母亲巫后，才知石像是巫后所变。巫后问明李逍遥对灵儿的情意后，就将他传送到十年前的南绍城。
南绍城·黑苗族王宫
李逍遥被传送到一处郊野，见到数名黑苗族士兵奉拜月教主之命，正在追杀正带年仅6岁的灵儿逃离苗疆的姥姥。李逍遥杀死这些士兵，姥姥向她道谢后带灵儿乘凤凰离开。随后又有另一批黑苗士兵来到，李逍遥再次打败这些黑苗士兵，为避免麻烦，李逍遥也换上黑苗服装。向西走看到一艘小船，船上的黑苗士兵要他一起到王宫***。南绍城此时为大水所淹，拜月教主认为是巫后所为，鼓动士兵胁迫巫王处死巫后。李逍遥潜入王宫中的监牢见到被囚禁的巫后，巫后要他到王宫地下宫殿取回天蛇杖，以便脱困。
南绍城·地下宫殿
李逍遥告诉地下宫殿石长老一句巫王交待的暗语。进入地下宫殿取回被巫王没收的天蛇杖，将天蛇杖交给监牢中的巫后。两人正要逃离，巫王和拜月教主来到，拜月教主施法，使巫后露出蛇尾人身的原形，迫使巫后带着李逍遥逃往王宫下面的地下水道。
南绍城·地下水道
在地下水道，李逍遥和巫后遇到拜月教主带着水魔兽前来追杀。原来拜月教主破坏女娲的封印，召唤太古魔兽造成了水灾，却利用巫后不是人类而嫁祸给她。由于水魔兽遇水即生，因此只能暂时将她打败，却无法彻底消灭。巫后带着李逍遥且战且逃，终于无路可逃，最后巫后牺牲自己消灭水魔兽，而将李逍遥传送到他家附近的山神庙。
山神庙
李逍遥被传送到离家不远的山神庙，见到了十年前的自己。才9岁的他说山神庙里来了一位受伤的老婆婆和一位小女孩。李逍遥进去一看，原来是姥姥和灵儿逃难至此。姥姥给他带一条凤纹手绢作为信物，到港边找接应的人。
小镇·港口
李逍遥来到港口，一位船上的商人认得这条凤纹手绢，原来他就是灵月宫主所变。灵月宫主带姥姥和灵儿回仙灵岛躲藏。行前她告诉李逍遥有一种叫做回魂仙梦的法术能够使人在梦中看到过去，如果想要结束这个梦，只要满足做梦之人心底的愿望即可回到现实。
山神庙
李逍遥在从山神庙西南小路的树下小箱子中见到一颗很特别的小珠子，9岁的李逍遥过来阻止，说这颗珠子是父亲送给他的，李逍遥和小时候的自己商量，以一柄木剑交换这颗水灵珠。身上没有木剑，可到小镇港口处的木匠铺里买一把。
大理城·女娲神殿
得到水灵珠后，李逍遥又重回女娲神殿的石像前，见到阿奴正在为他的安危祷告。原来他已失踪一个月了，小凤凰也已经出生了。
苗疆·圣姑家
李逍遥将取得的凤凰蛋壳和麒麟角交给圣姑，数月后灵儿顺利生下一个女儿，取名为忆如，以纪念月如。圣姑要李逍遥到试炼窟中抓36只傀儡虫回来。
苗疆·试炼窟
从大理城外向东南方向走可到试炼窟。半道上李逍遥遇见盖罗娇正在训练五毒兽以对抗黑苗族，为避免秘密泄漏，想灭口，李逍遥不得已只好出手还击，打败她后，阿奴出现阻止盖娇奴再度拼命。盖罗娇离去后，李逍遥和阿奴一起进入试炼窟。阿奴提到传说试炼窟深处有女娲的陵墓，但没有人能够到达。李逍遥一边打败怪物，获得傀儡虫，一边往地底深处走，在女娲陵墓外放置兵马俑的大厅西南方找到一个幻像墙，穿墙而过后，先到北边的石室取得芦苇漂，再到南边水道使用芦苇漂，经过一个水上迷宫，就到了女娲陵墓。在此可得到玄冥宝刀，无尘剑、金罡珠、冥蛇杖等至宝，并可以学到土神、
[锁妖塔]
从锁妖塔顶层出发一直向下层走，中途遇见蜀山***的灵魂得到七星剑，蜀山***误认为李逍遥是蜀山***却来此禁地，于是替蜀山处罚李逍遥，但最终战败于李逍遥和林月如，灵魂也因此得到解放，其女儿姜婉儿出现答谢两主角。随后在下面层解救了天鬼王，天鬼王要以吃了主角们作为报答（很奇怪的报答方式），但最终被主角劝服，以帮两人打开通向下一层的通道作为报答。来到该层北面，天鬼王出现打开了通向下层的大门。之后还遇见了沉思鬼阻拦路，无奈主角们在该层找到了自认为聪明过人的书中仙帮忙解答了沉思鬼的疑问，最后通向底层七星盘龙柱。在那里，李逍遥终于遇见了变成蛇身地赵灵儿，锁在其中一龙柱上。伤心的李逍遥回忆起过去的事情，并想起被忘忧散所忘却的记忆。两人解救了赵灵儿下来，却招到镇狱明王的阻止。三人合力打败镇狱明王后，天鬼王等妖怪出现，表示佩服主角们，并希望他们能想到离开锁妖塔方法。书中仙告知主角们从化妖池水底击破所有龙柱就能解救大众，于是三人到附近找到进入化妖池入口，进入水底并消灭所有盘龙，锁妖塔随之崩溃。天鬼王和众小妖顺利逃离；姜婉儿更来到尚书府门口，被云姨收留，但主角三人，林月如在救李逍遥和赵灵儿时被压下来的碎石压倒。
[神木林]
李逍遥梦见林月如后醒来，发现在圣姑家（三人被剑圣救起）。圣姑告知李逍遥赵灵儿怀孕并受伤了，需要李逍遥找需要凤凰蛋壳、麒麟角做药材医治，但林月如已经无法救治。李逍遥在林月如遗体前大哭。圣姑送走了剑圣，李逍遥也出发先到神木林找凤凰蛋壳。千辛万苦找到凤凰并把它赶跑并得到风灵珠，却被阿奴偷走了凤凰蛋。李逍遥追阿奴，不振被掉到树下。阿奴用卖魂术救醒了李逍遥，阿奴知道李逍遥的目的后答应凤凰蛋孵出小凤凰后才把凤凰蛋壳给李逍遥，但要李逍遥协助她到树洞偷木道人收藏的宝物。进入树洞中，来到宝物收藏地却没有找到水灵珠，只好拿了其他宝物后离开。[可选剧情：欲进入桃花源，发现很大雾无法通过，于是使用风灵珠吹散大雾，在桃花源找到桃源村，遇见阿桃等人并得知村长被木道人抓去了，于是启程找木道人。途中遇见宋公子，在他指引下找到木道人并消灭了他，救出了村长。村长成全了宋公子和阿桃姑娘的这一对，并为了感谢主角两，赠送了寿葫芦，之后村民全部变回桃树，主角们也离开桃花源]回到圣姑家，得知阿奴是圣姑徒弟。之后两人起程去大理城。从圣姑家出来的东北面的树洞进去，上山后走过木桥就来到了大理。
[大理]
到达大理，此时大理正泛旱灾。[可选剧情：麒麟洞门口的一户人家，一男子向主角兜售仙剑，并要求主角用身上全部的钱购买。但购买后，男子马上开溜，两主角才发现上当受骗了。]阿奴和李逍遥试图进入麒麟洞，可惜被两个守卫拒绝。于是阿奴又到大理的东北边找到娘亲（族长）[可选剧情：遇见一可以村民，发现他为黑苗族间谍，并将他消灭]，又因为他们开会而赶了阿奴出来。但从会场下来发现一看守麒麟洞的守卫抓到一黑苗士兵，准备前去报告。阿奴灵机一动，带李逍遥再次来到麒麟洞，命令剩下的守卫去找走开的守卫，于是骗走了守卫，进入麒麟洞。麒麟洞中找到火麒麟，并与之战斗。火麒麟最终化做人型，了解主角来的目的后送出了自己的麒麟角，并告诉两人到女娲神殿一趟。两人按麒麟老人意思来到女娲神殿，李逍遥在跪拜女娲象时，忽然发现女娲象很象赵灵儿，于是走上石象前，还被吸了进去。李逍遥随后见了赵灵儿娘亲巫后，巫后要李逍遥回去十年前做一件他应该做的事。
于是李逍遥回到十年前黑苗族地方，遇见了十年前的赵灵儿和她的姥姥正被黑苗人围困。李逍遥上前杀退了敌人，使赵灵儿和姥姥顺利乘凤凰离开。李逍遥为了掩饰身份，换上黑苗人的衣服，乘黑苗人的船来到南绍此时南绍正泛洪水。李逍遥来到南绍宫殿，发现拜月教主准备号召各黑苗士兵消灭巫后以消水患。李逍遥进入宫殿，从殿内右上角入口进入底下监狱，找到巫后，并劝服了巫后逃生。巫后拜托李逍遥帮她找她的天蛇杖。于是李逍遥上回地面，从宫殿的左上角入口进入地下，把巫后告诉李逍遥的暗号传达给看守入口的石长老，于是石长老让你进去取天蛇杖。李逍遥拿到天蛇杖回到监狱并交给了巫后，两人正要离开，拜月教主和巫王带领士兵来到阻挠。拜月教主使用法术逼巫后变成蛇形，李逍遥正想阻挠敌人，被巫后拉着一同跳入水中。不料拜月教主在水底养了水魔兽，并且在水中会有不灭之身。两人只好一直逃走，最后走投无路。巫后使用风咒把李逍遥送上水面，自己和水魔兽同归于尽。
李逍遥回到地面，却又遇见追赶而来的拜月教主。正巧石长老也来到，拜月教主命令石长老对付李逍遥，但却被李逍遥击败。石长老不甘失败，准备使用绝招赤血毒焰，此时凤凰飞来，抓伤了石长老的左眼并带走了李逍遥。 （新仙剑奇侠传中才有这节）
凤凰把李逍遥带到了曾经出现在李逍遥梦中的罗刹洞。李逍遥通过了洞内迷宫并找到罗刹鬼婆将她真正消灭。此时林月如忽然出现，并和李逍遥开战，使李逍遥很困惑。幸好书中仙出来提醒李逍遥这是幻觉与现实的较量，必须相信自己的判断。于是李逍遥克服了心魔，消灭了冒牌的林月如。此时凤凰再次出现，把李逍遥带到了十年前余杭的山神庙。 （新仙剑奇侠传中才有这节）
李逍遥看见了十年前的自己并告诉他山神庙内有一受伤女子（赵灵儿的姥姥）请求帮忙。李逍遥进去庙内，女子请求李逍遥拿着凤纹手绢找灵月公主前来帮忙。李逍遥来到余杭码头，向一商船船主出示凤纹手绢，商人还原为灵月公主，回去帮助山神庙内的女子。灵月公主和赵灵儿姥姥等人正准备告别李逍遥，李逍遥上前询问如何结束一场梦，得知只要完成要做的事情就能回到现实。灵月公主离去，此时李逍遥的婶婶前来寻找小李逍遥。李逍遥回到山神庙附近，遇见正在帮婶婶寻找小李逍遥的香兰，随后李逍遥从山神庙往下走来到自己过去最喜欢去的地方，并发现一个盒子内装有水灵珠，此时小李逍遥忽然出现，并收起了盒子。李逍遥提出用木剑交换盒子内的水灵珠，小李逍遥同意，于是李逍遥得到了水灵珠。但还是没有回到现实。来到码头，遇见以为正急于聘请船工的商人，李逍遥闲着没事做，于是上船帮忙，随船来到苏州。在苏州城门口忽然发现十年前的林天南和林月如，此时四周朦胧，李逍遥回到了现实。
李逍遥回到大理的女娲神店，此时凤凰蛋已经孵出了凤凰，得到了凤凰蛋壳。李逍遥和阿奴回到圣姑家，不久李逍遥和赵灵儿的女儿李忆如出世。圣姑拜托李逍遥从屋后去试炼洞帮忙寻找36个傀儡蛊。李逍遥独自出发，却在路上遇见了正在训练毒兽的盖罗娇。盖罗娇以为李逍遥前来偷看机密，于是和李逍遥交战起来。此时阿奴赶到，并向盖罗娇解析清楚，两人才解除误会。阿奴和李逍遥进入试炼洞[可选剧情：试炼洞内遇到一太小的洞，主角无法进入，于是阿奴放出自己饲养食蛊鸟进入洞中食蛊。食蛊鸟出洞后会产下很多蛊卵][可选剧情：试炼洞底下每层都有一座女娲遗迹，每座遗迹中可以找到呼唤神仙的咒文，一共有五个地点，可以学到五种咒文]，收集足够傀儡蛊后回到圣姑家交给圣姑。不久赵灵儿康复，加入主角队伍，开始起程到大理的女娲神殿。来到大理，发现黑苗人前来偷袭，一路杀敌，主角们来到女娲神殿。
赵灵儿跪拜娘亲的石象，女娲象显灵，并把圣灵珠、圣灵披风和天蛇杖传授给赵灵儿。三人下一层阶梯，由神殿东北面走去来到祭雨坛。赵灵儿把圣灵珠安放在坛边的石碑上，坛的四周立即出现四个台座。把水、土、风、雷、火灵珠摆放在台座上（不用管顺序，只要在物品里使用这五颗灵珠，珠子就会自动就位。注意，摆放前一定要卸下装备的灵珠，否则珠子不会在物品中出现），五灵珠显灵，赵灵儿念起了祈雨咒文，随即大雨降临，大理干旱大地回复生机，黑苗人以为女娲显灵，统统慌忙逃跑。
白苗人民马上召开庆祝大典，不料黑苗派来的地魔兽从地面冒出，三为主角前去消灭之，决定继续前进彻底消灭拜月教。从地魔兽出现的洞口进去，来到白苗神殿往南绍城地下迷宫。
[南绍城]
通过地下迷宫，三人来到南绍城，在南绍大殿上，赵灵儿在大厅与巫王见面，此时拜月教主出现，并使两手下与三位主角开战。战胜两手下后，趁众人不镇，巫王手变成尖刀，插入赵灵儿后背，赵灵儿受重伤。巫王变成树精，众人才知道此巫王由树精变成，真正的巫王已经被拜月教主所杀。气愤的李逍遥和阿奴消灭了树精。阿奴紧跟着给赵灵儿急救，李逍遥冲出大厅，找拜月教主报仇，一会儿阿奴也赶到。赵灵儿奇迹般复活过来出现在两主角间。三人齐心协力打败了拜月教主。拜月教主不甘失败，跳入的水池。众人以为已经胜利时，忽然听见水底水魔兽的声音，因此决定下水把水魔兽消灭。
来到水底，遇见了水魔兽，惊奇的发现拜月教主啖食了水魔兽，并与水魔兽结合为一体。三人再次与拜月教主交战。经过艰辛的斗争，终于再次战胜拜月教主。赵灵儿在战斗中不镇使背后的伤口裂开，血液流到水中，竟被临终的拜月教主吸取（赵灵儿流有女娲血统）而得到不死身。拜月教主准备再次对付三人，赵灵儿急忙使用风咒送李逍遥和阿奴上地面。可怕的拜月教主冲塌了地面，掀起了洪水淹没了南绍城。阿奴不镇被卷入水中，李逍遥匆忙潜入水中营救阿奴。赵灵儿使用全身灵力，决定完成娘亲未完成的事情，以自己的身体封印拜月教主。战斗结束。
夕阳，李逍遥和阿奴站在屋顶，只看见赵灵儿的天蛇杖回到地面，却不见赵灵儿的身影。李逍遥也要离开阿奴踏上回归的路。依依不舍的阿奴在山头吹起送别的笛声。回归的路上，李逍遥遇见了复活的林月如（这就是圣姑要你找36条傀儡蛊的作用了），正抱着李忆如，等待着李逍遥……
出来后可以见到一村庄,到北边找到韩医生 (也找到灵儿), 把医生给你的药方拿给门口的煎药童子,他会告诉你需要 人参、雪莲子、何首乌、银杏子、鹿茸、鲤鱼 这些药材,其中你只要找 鲤鱼、鹿茸、银杏子 就可以了,其它的月如会帮你找,先到下方渔夫家中借钓具再到湖旁边使用钓具就会得到鲤鱼,然后从下方出村庄,村门口有人告诉你路上放了捕兽夹,走一段路后看到补兽夹,把它拿起来,放到鹿常跑的路上,然后把鹿『赶』到捕兽夹,调查鹿就可以得到鹿茸,然后回村装韩大夫家,在韩大夫家后面有一颗杏树,调查可得到银杏子,把药材集全后拿给煎药童子,把煎好的药拿给灵儿喝,灵儿复原后加入。
